Навигација

13М111ГИ - Геномска информатика

Спецификација предмета
НазивГеномска информатика
Акроним13М111ГИ
Студијски програмЕлектротехника и рачунарство
Модул
Тип студијамастер академске студије
Наставник (предавач)
Наставник/сарадник (вежбе)
Наставник/сарадник (ДОН)
    Број ЕСПБ6.0Статус предметаизборни
    Условљност другим предметимаПредмет Проналажење скривеног знања (13М111ПСЗ) није предуслов за предмет Геномска информатика (13М111ГИ) али се препоручује узимање 13М111ПСЗ пре узимања 13М111ГИ и зато је овај предмет смештен у пролећном семестру, тако да се може узети након предмета 13М111ПСЗ који је смештен у јесењем семестру.
    Циљеви изучавања предметаУ оквиру овог предмета представљени су основни методи рачунарске анализе података добијених из генома, са циљем извођења биолошки значајних закључака. Биће указано на предности и мане ових метода и на значајне параметре који утичу на резултате ових анализа.
    Исходи учења (стечена знања)Студенти ће разумети принципе дизајна алгоритама за обраду биолошких података и како они раде. Биће способни да анализирају проблеме и примене одговарајуће методе.
    Садржај предмета
    Садржај теоријске наставеПоређење секвенци. Скривен Марковљев модел. Алгоритми за вишеструко поравнање. Анализа експресија гена. Популациона геномика. Молекуларна еволуција. Компаративна геномика.
    Садржај практичне наставеПрактична настава ће тематски пратити теоријску наставу.
    Литература
    1. R. Durbin, S. Eddy, A. Krogh, G. Mitchison, "Biological Sequence Analysis", Cambridge University
    2. N. Jones, P. Pevzner, "An Introduction to Bioinformatics Algorithms", MIT Press
    3. D. Gusfield, "Algorithms on Strings, Trees and Sequences", Cambridge University Press
    4. Најновији радови по избору предавача
    Број часова активне наставе недељно током семестра/триместра/године
    ПредавањаВежбеДОНСтудијски и истраживачки радОстали часови
    221
    Методе извођења наставеПредавања и аудиторне вежбе се држе уз електронске презентације. Студенти самостално израђују пројекте.
    Оцена знања (максимални број поена 100)
    Предиспитне обавезеПоенаЗавршни испитПоена
    Активности у току предавањаПисмени испит50
    Практична наставаУсмени испит
    Пројекти50
    Колоквијуми
    Семинари